La génomique désormais accessible pour les femelles comme pour les mâles

Les jours du testage sont comptés depuis que la génomie révolutionne la sélection bovine. Le service de génotypage GD Scan de Gènes Diffusion s’ouvre aux femelles charolaises dès juillet 2014 et aux mâles de monte naturelle à partir d’octobre. Les éleveurs charolais pourront désormais connaître le potentiel génétique d’un animal simplement en prélevant une touffe de poils de sa queue, et ce dès sa naissance. Soit une économie de quatre années de testage pour un taureau d’IA.

« Nous avons initié ce projet en 2009, en collectant de nouveaux phénotypes sur plus de 8.500 animaux, comme la morphologie des trayons ou l’instinct maternel », raconte Sébastien Landemaine, technicien Charolais chez Gènes Diffusion. Cette population de référence a permis d’établir une dizaine de prédicteurs génomiques de synthèse. Notés de 1 à 10, ces critères génomiques sont améliorateurs au-delà de 5. »

4 prédicteurs de production :

• Facilité de naissance
• Potentiel de croissance
• Aptitude au vêlage
• Aptitude à allaitement

4 prédicteurs de morphologie :

• Longévité de la mamelle
• Fonctionnalité des trayons
• Solidité des aplombs arrière
• Locomotion

2 prédicteurs de comportement :

• Comportement vis-à-vis de l’homme
• Instinct maternel vis-vis du veau

Autres caractères testés :

• Statut culard (non porteur, porteur hétérozygote ou homozygote)
• Statut sans corne (non porteur, porteur hétérozygote ou homozygote)
• Vérification de compatibilité génétique (test de parenté/filiation)

« Les avantages de la génomique sont nombreux que ce soit pour la voie femelle comme pour la voie mâle. La meilleure connaissance de la valeur génétique des veaux permet de trier ses reproducteurs précocement et de piloter plus finement les accouplements selon ses objectifs de sélection », rappelle Sébastien Landemaine.

Source : Gènes DiffusionLes premiers résultats obtenus sur des taureaux connus sur descendance semblent proches des index Iboval, avec une corrélation d’environ 80 %. Quant aux CD génomiques (fiabilité des index), ils varient de 0,25 à 0,53 selon les caractères étudiés. Comme pour la génomie des races laitières, les mesures d’héritabilité des caractères sont plus élevées sur la morphologie que sur les caractères fonctionnels réputés plus complexes (lait, comportement…). Certains caractères se sont révélés antagonistes, par exemple, une vache très maternelle sera aussi potentiellement plus agressive vis-à-vis de l’homme.

Monte naturelle

Alors que les éleveurs laitiers n’ont toujours pas le droit de faire génotyper un mâle pour leur propre compte, au risque de venir faire de l’ombre aux entreprises de sélection, Gènes Diffusion  a fait le choix de donner l’accès aux éleveurs au génotypage de leurs taureaux. « La saillie naturelle est prépondérante dans les élevages allaitants : en Charolais environ 13 % des veaux naissent d’IA. D’où l’importance de proposer une évaluation génomique aussi sur les taureaux de monte naturelle, car sans cela, l’impact d’un taureau utilisé en monte naturelle se mesure tardivement et peut s'avérer lourd de conséquences sur la qualité du renouvellement », fait remarquer Michel Fouchet de Gènes Diffusion.

50 à 230 € le génotypage

Question tarifs, l'analyse coûtera 50 € HT pour les femelles pour 20 kits achetés, ou 65 € à l’unité. Pour faire génotyper un mâle charolais destiné à la monte naturelle, le prix s’élève à 230 € HT l’analyse et si le taureau est retenu pour être diffusé en insémination artificielle, le propriétaire de l’animal devra verser 5 € par IAT. Il faut compter un délai d’environ deux mois entre le prélèvement de poils et l’obtention des résultats génomiques.

Taureaux génomiques au catalogue

Gènes Diffusion propose actuellement cinq taureaux génomiques dits "Premium" à son catalogue :

• Fédéral (Tinor/Rethel) : réputé docile
• Flabas (Tejoyeux/Habit) : allaitement facile et morphologie mamelle et trayons
• Hulk (Artois/Pinay) : solidité et locomotion
• Honorable (Bastion/Pinay) : pour faire des broutards
• Hispanic (Artois/Pinay) : pour le renouvellement

Par ailleurs, l’entreprise de sélection travaille sur le gène sans corne dans le schéma Charolais Optimal ainsi que sur les taureaux charolais à muscularité précoce (gamme Gen’Cross) destinés au croisement industriel. Grâce à sa plateforme génomique basée à l’institut pasteur de Lille, Gènes Diffusion participe également aux projets de recherche nationaux tel que Dégéram (développement de la génomique des races du massif) qui vise notamment à améliorer la viabilité des veaux par la voie génétique avec des recherches sur la qualité du colostrum et l’ouverture pelvienne par exemple.