Une enquête judiciaire avait été lancée à la suite d'une plainte en 2002 avec constitution de partie civile de l'Union nationale de l'apiculture française (Unaf) et de deux associations apicoles du Lot-et-Garonne. La société a confirmé l’information sans faire plus de commentaire.
Syngenta est soupçonnée d'avoir fait enfouir, entre 1999 et 2002 par un agriculteur, avec qui elle avait conclu un accord financier, des tonnes de semences périmées enrobées d'insecticides, parmi lesquelles du Gaucho. La réglementation en vigueur oblige à l'incinération de ces déchets. L'agriculteur a lui aussi été mis en examen. L'affaire a été instruite à Marmande avant d'être transférée au pôle santé publique du tribunal de Paris en janvier 2006.
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