Le chromosome 12 pourrait abriter un gène responsable d'anomalies congénitales

« Les résultats prometteurs obtenus grâce à la base de données Anoporc et au programme de recherche SwAn initiés en 2006 ont permis d’identifier un signal fort d’association entre le caractère intersexué et des marqueurs d’une petite région du chromosome 12 » (© Terre-net Média)

Bien que la fréquence des anomalies congénitales soit relativement faible (environ 1 % en Europe), leur impact en production porcine est significatif.
Les anomalies les plus fréquentes sont les hernies scrotales et inguinales, la cryptorchidie et l’intersexualité ; dans une moindre mesure les atrophies ou dissymétries testiculaires… bref, un mal-être pour les animaux avec parfois des rétentions urinaires et des tremblements également rencontrés dans les élevages (à différents étages de la pyramide de production).

Au final, la perte économique due à ces défauts est estimée à plusieurs millions d’euros par an. « L’impact de ces défauts sur le bien-être des animaux n’est également pas à sous-estimer, certaines de ces anomalies causant une mortalité accrue des porcelets, d’autres nécessitant l’euthanasie des animaux », précisait Juliette Riquet (Inra), lors de son intervention pendant les Jrp, en février 2011 à Paris.

Les chercheurs ont bien identifié des facteurs alimentaires et environnementaux à ces anomalies. Mais des causes génétiques ont également été mises en évidence pour les principales anomalies. « Plusieurs études ont déjà été réalisées sur le sujet pour estimer les paramètres génétiques dans différentes races porcines. »

Deux programmes de recherche

L’évolution de la génétique et des outils moléculaires mis en place permettent aujourd’hui de réaliser aujourd’hui une analyse systématique « de l’ensemble du génome et de mettre en évidence les régions chromosomiques portant des gènes responsables de ces défauts ou de leur apparition en interaction avec l’environnement » détaillait Juliette Riquet.Ces outils permettent en particulier d’identifier plus facilement des gènes et les mutations causales, « bien qu’à ce jour, aucune mutation n’a pu être identifiée par des chercheurs » poursuivait la spécialiste de l’Inra.

Ce qu’il faut retenir Les résultats obtenus à partir d’animaux atteints d’intersexualité issus de la base de données Anoporc sont prometteurs. Parallèlement la même démarche a été suivie à partir de familles atteintes d’hernies scrotales/inguinales et de cryptorchidie. « Des résultats intéressants ont été obtenus pour les hernies, que nous devrons néanmoins confirmer dans les mois à venir », annonçait en février dernier à l’occasion des Jrp Juliette Riquet (Inra). Les causes de ces anomalies sont peu connues et d’origines diverses (alimentation, sanitaire et génétique). « Ce travail devrait nous permettre de mieux connaître les facteurs génétiques de certaines maladies et de prendre en compte le génotype des animaux aux gènes responsables dans le choix des reproducteurs. »

En 2006, l’Ifip et les organisations de sélection porcine Adn, Gene+, Nucleus et Pen Ar Lan (réunis au sein de Bioporc) ont inscrit cette problématique dans leurs priorités.

À la suite de cette décision, deux programmes de recherche ont été mis en place en partenariat entre l’Inra et Bioporc : Anoporc et SwAn.

Anoporc contient notamment une banque de données phénotypiques et moléculaires, tandis que SwAn utilise cette collection pour la recherche des gènes responsables de l’apparition de ces anomalies.
Ainsi, grâce à ces deux outils, la filière porcine s’est aujourd’hui donnée les moyens de « développer un outil moléculaire permettant la contre sélection de ces défauts dans les populations porcines françaises ».

Signal fort d’association

De 2006 à 2009, les travaux se sont focalisés sur la description des principales anomalies en vue de la rédaction de fiches destinées aux professionnels. « Notre objectif était de réaliser au fur et mesure du temps une collection de données phénotypiques et d’échantillons biologiques exploitables en génétique moléculaire, à savoir la collection Anoporc. »

Depuis 2009, la collection ainsi établie est utilisée pour identifier les régions du génome contenant les gènes responsables des anomalies (ou de leur apparition) les plus fréquentes. « Il s’agit du développement du programme SwAn » qui livre aujourd’hui ses premières informations.

La principale information de l’analyse moléculaire de la collection Anoporc est que les scientifiques ont identifié « un signal fort d’association entre le caractère intersexué et des marqueurs d’une petite région du chromosome 12 », concluait Juliette Riquet. 

Pour aller plus loin Ifip-Institut du porc : www.ifip.asso.fr. Une première étape franchie pour l’établissement de marqueurs génétiques, lire ici